एमएटी मैसीडोनियाई एयरलाइंस मैसीडोनिया की राष्ट्रीय हवाई यात्री एयरलाइंस थी। इसे पहले १९९४ में मैसीडोनियाई एयरलाइंस के नाम से स्थापित किया गया था, लेकिन १९९५ में इसका नाम एमएटी मैसीडोनियाई एयरलाइंस में बदल दिया गया। यह एयरलाइंस घरेलू और अंतरराष्ट्रीय उड़ानें चलाती थी, जिसका मुख्य हब स्कोप्ये इंटरनेशनल एयरपोर्ट पर स्थित था।
एमएटी मैसीडोनियाई एयरलाइंस ने बोइंग ७३७ और फोकर १०० विमान समेत एक फ्लीट ऑपरेट किया। यह मालगाड़ी और यात्री परिवहन, समेत चार्टर उड़ानें जैसी सेवाएं प्रदान करती थी। यह एयरलाइंस यूरोप, मध्य पूर्व और उत्तर अफ्रीका के लक्ष्यों की सेवा करती थी।
हालांकि, आर्थिक कठिनाओं के कारण, एमएटी मैसीडोनियाई एयरलाइंस ने २००९ में संचालन बंद कर दिया। मैसीडोनियाई सरकार ने २०१२ में इस एयरलाइंस को एलेक्जेंडर द ग्रेट एयरलाइंस के नाम से फिर से जीने की कोशिश की, लेकिन यह प्रयास सफल नहीं रहा।
वर्तमान में, मैसीडोनिया में कोई राष्ट्रीय ध्वज वाली कंपनी नहीं है, लेकिन विभिन्न अंतरराष्ट्रीय एयरलाइंस स्कोप्ये और ओह्रिड एयरपोर्ट से उड़ानें चलाती हैं।